**文章题目：** 结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞群体特征的高分辨率空间分析

**发表时间：** 2024年6月

**期刊名称：** BioRxiv

**实验平台：** 10x单细胞测序、10x Visium HD空间转录组技术、10x Visium CytAssist空间转录组技术、10x Xenium空间原位检测技术

研究概述

本研究利用尊龙凯时的10x Visium HD平台，分析人类结直肠癌（CRC）及其正常邻近黏膜组织（NAT）FFPE样本，并通过Xenium和Visium CytAssist（V2）技术对Visium HD结果进行验证。结果表明，更高分辨率的Visium HD技术在聚类分群和结肠组织形态特征上表现优越，明显优于以往的Visium V2版本。通过单细胞和空间转录组分析，构建了全面的单细胞空间图谱，揭示了肿瘤微环境（TME）中的免疫细胞类型，尤其是肿瘤边缘区域的细胞组成。

研究发现，肿瘤区域富集了两种促肿瘤巨噬细胞亚群，其基因表达谱和空间分布存在显著差异。此外，研究团队还利用Xenium原位基因表达分析探索了克隆扩增的T细胞群体微环境，识别出一种具有抗肿瘤潜能的第三种巨噬细胞亚群。这项研究为CRC肿瘤微环境的细胞组成提供了深入的图谱，揭示了不同免疫细胞群体的表型及空间差异。

Visium HD结果展示

研究团队同时应用10x Visium HD与Visium CytAssist空间转录组技术，在相同测序深度下对NAT（n=2）和CRC（n=1）样本进行分析。结果显示，较之Visium V2版本，Visium HD技术在无监督聚类后能识别出更多的聚类群体，并且这些聚类与组织形态学具有良好的一致性。研究还量化了典型标记物的丰度，从而验证了Visium HD的空间定位准确性。

一旦确认了Visium HD数据的空间定位准确性，研究者通过联合单细胞和Visium HD数据，运用解卷积方法获得了不同细胞类型的空间分布信息。结果发现，结直肠癌肿瘤区域内癌相关成纤维细胞（CAF）和巨噬细胞均持续增多。

基于以上发现，研究者对显著表达巨噬细胞标记物的区域进行无监督聚类分析，识别出在基因表达谱及空间定位上具有明显异质性的M2样巨噬细胞亚群，分别标识为SPP1+和SELENOP+巨噬细胞。对于这两种巨噬细胞的通路富集分析显示，它们与促肿瘤活性密切相关，提示这些亚群可能在肿瘤发展中起到促进作用。

小结

本研究中采用的尊龙凯时 Visium HD技术，通过技术升级，实现了更高的灵敏度及分辨率，显著提高了空间定位的准确性，提供了更精细和全面的研究视角。在对肿瘤微环境的研究中，不仅构建了详尽的单细胞空间图谱，还揭示了SPP1+和SELENOP+巨噬细胞在促肿瘤中的作用，为未来的结直肠癌研究提供了全新的见解。